1、商業(yè)性質(zhì)不同
免稅店是經(jīng)海關(guān)總署批準(zhǔn)，由經(jīng)營單位在中華人民共和國國務(wù)院或其授權(quán)部門批準(zhǔn)的營業(yè)地點，是向規(guī)定的對象銷售免稅的商品。而專柜則是一般商業(yè)性質(zhì)，指的是個體經(jīng)營戶在符合國家政策法規(guī)的情況下，向工商部門申請的有一定經(jīng)營范圍的商店。
2、服務(wù)對象不同
免稅店主要面向的是因公出國人員、遠(yuǎn)洋海員、華僑、外籍華僑、港澳臺同胞、出國探親的中國公民及在國內(nèi)的外國專家等。而專柜則是面向于所有的消費者，不分身份。
3、商品標(biāo)簽不同
免稅店一般都有機(jī)場包裝，內(nèi)容物大致相同，在成分上沒有太大的差別，但是并非所有商品都是如此，有些品牌在免稅店、專柜售賣的產(chǎn)品，是存在差別的，主要根據(jù)品牌而定。
